监测结果显示，目前重灾区报告的法定传染病主要有流行性腮腺炎、肺结核、其他感染性腹泻、乙肝、痢疾、风疹、艾滋病、甲肝和手足口病等，均为散发病例，无聚集性发病现象。
统计表明，四川灾区目前的传染病发病总数与去年同期相比无显著增加。灾区无鼠传疾病和传染病暴发疫情等突发公共卫生事件报告。
截至6月10日12时，四川灾区已为50多万人接种甲肝、乙脑疫苗。防疫人员累计开展消杀面积超过27亿平方米，集中安置点食品、饮用水卫生监督措施落实率超过90%，并制订了堰塞湖避险安置点及过水区公共卫生应急预案。专家通过对过去3年灾区甲肝、乙脑等传染病发病的本底资料分析发现，当地人群抗体水平不高。而且，大量北方地区援川人员进入及高温多雨季节的到来，蚊蝇等虫媒极易孳生，进一步加大了疫病暴发的风险。此外，堰塞湖泄洪后，鼠类生活环境改变，可能诱发鼠传疾病。为此，卫生部要求继续加大灾区群众预防接种工作力度和覆盖面，大力开展以杀灭“四害”为主的爱国卫生运动，特别注意指导北方地区援川人员做好南方传染病的预防工作。
